AlphaFold3 是基于扩散模型（Diffusion）+ 注意力机制的新一代结构预测系统，2024-05 由 DeepMind 与 Isomorphic Labs 联合发布于 *Nature*。相比 AlphaFold2 仅支持蛋白质单体，AlphaFold3 一次性覆盖蛋白质 - 蛋白质 / 蛋白质 - 核酸（DNA/RNA）/ 蛋白质 - 小分子配体 / 蛋白质 - 离子等几乎所有生命分子复合物体系
AlphaFold 系列 2024 年发布的第三代模型，从单一蛋白质结构预测扩展到所有生命分子复合物，是 AI for Science 历史性突破。
…AI 革命 2018-2020 AlphaFold / AlphaFold2 数小时 / 高精度（GDTTS >90） 多模态扩展 2024+AlphaFold3/ Boltz-2 / AlphaProteo 蛋白 + 核酸 + 小分子复合物预测 + 从头设计 关键里程碑 · 2020-12：AlphaFold2 在 CASP14 竞赛中以 GDT…
Boltz-24 处…2025 年 MIT 与 Recursion Pharmaceuticals 联合发布的开源蛋白质结构 + 结合亲和力联合预测模型，对标AlphaFold3，速度比传统物理方法快 1000 倍且精度相近。 定义 Boltz-2 是同时预测蛋白质三维结构 + 配体结合亲和力的开源 AI 模型，区别于 AlphaFold3 仅预测结构，Boltz-2 一次性输出结构 +…
AlphaFold3 处…AlphaFold2 2020 CASP14 GDTTS 92.4 分碾压所有对手，基本解决蛋白质单体结构预测问题；注意力机制 + MSA 进化信息AlphaFold32024 扩展至蛋白质 - 蛋白质 / 蛋白质 - 核酸（DNA/RNA）/ 蛋白质 - 小分子配体，覆盖几乎所有生命分子 AlphaProteo 2024 从结构预测进入蛋白质设计（从…
AlphaProteo2 处…2. 生物催化：设计酶用于工业催化 3. 诊断试剂：开发新型识别探针 在 AI for Science 中的角色 · AlphaProteo 与AlphaFold3形成"预测 + 设计"双引擎，DeepMind 与 Isomorphic Labs 在大分子药物研发的护城河进一步加深 · 是 AI4S 从"被动预测"走向"主动创造"的关键标志…
生成式AI药物设计1 处…英矽智能：Chemistry42 平台 · 晶泰控股：ID4平台 · Isomorphic Labs：AlphaFold3驱动的分子设计 · Recursion Pharmaceuticals：Valence Discovery（被收购） · Schrödinger：物理建模 + AI 融合路径…
…Isomorphic Labs 是 Alphabet 旗下 AI 制药公司，卡在 AI 科学研究与药物发现之间，以 AlphaFold/AlphaFold3等结构预测能力切入小分子、大分子和分子胶设计。 公司已与 Eli Lilly、Novartis、Janssen Biotech 建立药物发现合作，2024 年 1 月两项合作合计潜在价值约 $3bn；…
星亢原1 处…客户：中国创新生物科技公司 + 部分 MNC 项目 在 AI for Science 中的角色 代表中国"AI 大分子设计"细分赛道的执行型公司，与全球AlphaFold3/ Boltz-2 等开源模型形成"应用端的本土化"互补关系。 与 AI 产业链关系 上游：核心逻辑芯片 云计算与智算平台 模型工厂…
…日期 2024-11 当事方 DeepMind / Isomorphic Labs 开源范围AlphaFold3代码（学术非商业用途） 协议 学术非商业开源，权重需申请获取 事件经过 AlphaFold3 于 2024-05 发布于 Nature，发布初期未开源。…
AlphaFold 获诺贝尔化学奖2 处…（DeepMind）—— 表彰其在蛋白质结构预测方面的突破，即 AlphaFold 的研发 获奖时 AlphaFold2 已完成 2 亿+ 蛋白质结构预测，免费开放给全球科研机构使用；AlphaFold3已于 2024-05 发布，扩展到 DNA / RNA / 小分子配体。 历史意义 · AI 首次获自然科学领域诺贝尔奖（区别于经济学诺奖此前授予过 AI 相关工作）…
